Εξήγηση: Πέντε βήματα για την ανίχνευση του κοροναϊού (COVID-19)

Η διαδικασία εξηγήθηκε στο The Indian Express από τον Dr V Ravi, Senior Professor & Head, Τμήμα Νευροϊολογίας, NIMHANS.

Το ψεύτικο αίμα εμφανίζεται σε δοκιμαστικούς σωλήνες με ετικέτα κορωνοϊού (COVID-19) σε αυτήν την εικόνα που λήφθηκε στις 17 Μαρτίου 2020. (Reuters)

Ο Δρ V Ravi, Ανώτερος Καθηγητής και Επικεφαλής του Τμήματος Νευροϊολογίας, NIMHANS, εξηγεί τη διαδικασία ανίχνευσης του κοροναϊού σε αυτόν τον ιστότοπο . Εδώ είναι τα πέντε βήματα:

Συλλογή και μεταφορά

Το κέντρο δοκιμών παίρνει επιχρίσματα από τις ρινικές κοιλότητες και το πίσω μέρος του λαιμού (φάρυγγας) και τοποθετεί δείγματα σε ένα μέσο μεταφοράς ιού, το οποίο περιέχει ισορροπημένα άλατα και λευκωματίνη για να αποτρέψει την αποσύνθεση του ιού. Στη συνέχεια, το δείγμα μεταφέρεται σε ψυχρή αποθήκευση στο εργαστήριο δοκιμών.

Εκχύλιση ιικού RNA

Οι κοροναϊοί όπως ο SARS-CoV (που εμφανίστηκε στην Κίνα το 2002-03), ο MERS-CoV (που εμφανίστηκε στη Σαουδική Αραβία το 2012) ή ο τρέχων SARS-CoV-2 που προκάλεσε την πανδημία COVID-19, έχουν μεγάλες , μονόκλωνα γονιδιώματα RNA. Το εργαστήριο δοκιμών εξάγει το RNA από τα δείγματα, χρησιμοποιώντας κιτ που διατίθενται στο εμπόριο (όπως αυτά που κατασκευάζονται από εταιρείες όπως η QIAGEN.)

Τοποθέτηση του RNA στο μίγμα PCR

chris tucker καθαρή αξία 2018

Το εκχυλισμένο RNA προστίθεται σε ένα μίγμα αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (PCR). Αυτό περιλαμβάνει το «κύριο μείγμα», το οποίο περιέχει ένα ένζυμο «αντίστροφης μεταγραφάσης» που μετατρέπει το RNA σε DNA. Το κύριο μείγμα περιέχει πολυμεράση Taq, το ένζυμο που δημιουργεί αντίγραφα του DNA, νουκλεοτίδια, καθώς και άλλα στοιχεία όπως το μαγνήσιο - ένα ιόν του οποίου απαιτείται για την ενίσχυση του DNA.

lewis Χάμιλτον εθνικότητα

Το μίγμα PCR περιέχει επίσης «αντιδραστήρια» όπως «primers» και «probes». Οι εκκινητές είναι συγκεκριμένοι κλώνοι DNA που έχουν σχεδιαστεί για να συνδέονται με το DNA που πρόκειται να αντιγραφεί. Οι ανιχνευτές χρησιμοποιούνται για την ανίχνευση της συγκεκριμένης αλληλουχίας στο δείγμα DNA. Ο ΠΟΥ έχει συστήσει συγκεκριμένους εκκινητές και ανιχνευτές για δοκιμές για COVID-19.

Τέλος, το μίγμα της PCR αποτελείται από ένα γονίδιο οικιακής φροντίδας — ένα φυσιολογικό ανθρώπινο γονίδιο (RNase P) που χρησιμοποιείται για να διασφαλιστεί ότι τα δείγματα συλλέχθηκαν σωστά και ότι το RNA εξήχθη.

Ενίσχυση του DNA του ιού

Το δείγμα, στο μείγμα PCR του, τοποθετείται σε σωλήνες ή πλάκες, οι οποίες στη συνέχεια τοποθετούνται σε μια μηχανή θερμικού κυκλοποιητή που χρησιμοποιείται για τη διεξαγωγή της διαδικασίας PCR.

Πρώτον, το RNA μετατρέπεται σε DNA. Στη συνέχεια ξεκινά η διαδικασία αντιγραφής των γονιδίων. Ο θερμικός κυκλοποιητής θερμαίνει και ψύχει το μείγμα με το δείγμα, εναλλάσσοντας τρεις θερμοκρασίες - για την τήξη του DNA για τον διαχωρισμό των δύο κλώνων, για τη σύνδεση του εκκινητή με το DNA και για τη σύνθεση ενός νέου κλώνου - όλα μέσα σε έναν κύκλο που διαρκεί ένα λεπτό. Ο θερμικός κυκλοποιητής εκτελεί 30-40 τέτοιους κύκλους για να ενισχύσει το DNA για να ελέγξει για τον ιό.

Δοκιμή έναντι των ελέγχων

Το ενισχυμένο DNA ελέγχεται έναντι ενός θετικού μάρτυρα, ο οποίος συνήθως αποτελείται από γονίδια του ιού που κλωνοποιούνται σε πλασμίδιο, και ενός αρνητικού ελέγχου, που είναι ένα «γνωστό» δείγμα που έχει βγει αρνητικό για τον ιό νωρίτερα.

Η RNase P θα πρέπει να παρουσιάζει ενίσχυση, ο θετικός έλεγχος θα πρέπει να είναι θετικός, ο αρνητικός έλεγχος πρέπει να είναι αρνητικός και, στη συνέχεια, όποιο αποτέλεσμα λάβετε για το δείγμα, είναι το σωστό αποτέλεσμα, δήλωσε ο νευροϊολόγος Dr V Ravi. Για να είναι έγκυρη μια δοκιμή πριν από τη δημοσιοποίηση του αποτελέσματος, πρέπει να πληρούνται ορισμένα «κριτήρια εγκυρότητας».

Μην χάσετε από το Explained | Πώς λειτουργεί το τεστ COVID-19

Εάν το γονίδιο housekeeping (RNase P) είναι θετικό, ο θετικός μάρτυρας είναι θετικός, ο αρνητικός έλεγχος είναι αρνητικός και το δείγμα δεν δείχνει κανένα θετικό αποτέλεσμα PCR, το δείγμα δηλώνεται αρνητικό για το RNA του ιού SARS-CoV-2. Εάν το αποτέλεσμα της PCR είναι θετικό, ο ασθενής έχει COVID-19.

Μοιράσου Το Με Τους Φίλους Σου:

καθαρή αξία zylka